Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cab39Q06138 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms