Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Larp7Q05CL8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms