Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox13Q04891 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox13Q04891 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms