Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox9Q04887 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox9Q04887 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms