Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top1Q04750 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Top1Q04750 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms