Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd1Q04519 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms