Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Scg2Q03517 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms