Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms