Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms