Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ascl1Q02067 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms