Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms