Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psmb4P99026 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psmb4P99026 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms