Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds1P98191 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms