Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfra1P97785 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms