Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx2P97474 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx2P97474 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx2P97474 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx2P97474 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx2P97474 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms