Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Meis3P97368 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Meis3P97368 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.1 ms