Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx1P83917 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx1P83917 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms