Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms