Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgcdP82347 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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