Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx1P81068 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx1P81068 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms