Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx3P81067 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms