Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx2P81066 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx2P81066 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms