Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp8a1P70704 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms