Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms