Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms