Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn1P70268 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms