Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps28P62858 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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