Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga11P61622 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms