Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arl1P61211 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arl1P61211 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl1P61211 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl1P61211 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl1P61211 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms