Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn18P56857 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn18P56857 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cldn18P56857 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn18P56857 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn18P56857 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn18P56857 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn18P56857 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn18P56857 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn18P56857 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn18P56857 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms