Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckbrP56481 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckbrP56481 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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