Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Aqp4P55088 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms