Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms