Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VdrP48281 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VdrP48281 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VdrP48281 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VdrP48281 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms