Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrprbP47758 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms