Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdf5P43027 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms