Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkx1-2P42580 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nkx1-2P42580 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms