Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept1P42209 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sept1P42209 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms