Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elk1P41969 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elk1P41969 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms