Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh4P39038 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh4P39038 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh4P39038 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh4P39038 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdh4P39038 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms