Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PpargP37238 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpargP37238 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpargP37238 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpargP37238 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpargP37238 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpargP37238 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms