Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stfa3P35173 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stfa3P35173 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stfa3P35173 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stfa3P35173 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stfa3P35173 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stfa3P35173 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stfa3P35173 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stfa3P35173 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stfa3P35173 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stfa3P35173 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms