Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tfap2aP34056 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2aP34056 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms