Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms