Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms