Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrbP28704 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrbP28704 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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