Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DcnP28654 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DcnP28654 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcnP28654 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcnP28654 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms