Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd9P28357 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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