Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb1P28230 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms