Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb9P28076 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms